國家能源局設在國家發改委門下，為副部級單位，被認為是部門改革的折中產物，其設立后，不再保留國家能源領導小組
“其實早在國家能源局成立的同時就已確定要成立國家能源委員會�！眹夷茉淳志C合司內部人士對記者表示，2008年國家能源領導小組撤銷后，其辦公室機構被并入國家能源局，但是能源工作必須要有一個更高層次的議事機構來統籌協調，國家能源委的工作將更多是從戰略層面統籌能源發展問題，而并不是一個具體的職能機構，也不會具體就某一項事務做決策。
2008年3月11日，國務委員兼國務院秘書長華建敏在第十一屆全國人民代表大會第一次會議就國務院機構改革方案即做出說明稱，“能源問題涉及多領域、多部門，為加強能源戰略決策和統籌協調，設立高層次的議事協調機構國家能源委員會，負責研究擬訂國家能源發展戰略，審議能源安全和能源發展中的重大問題�！�
決定設立國家能源委員會正值當年政府機構改革，設立“能源部”的呼聲高漲。由于我國能源管理問題涉及部門和行業眾多，一直存在九龍治水、政出多門的狀況，盡管歷史上，我國曾設立過能源管理部門，但終因各部門利益交織和分配難以均衡，能源部門也經歷了“三起三廢”。
新中國成立后，燃料工業部曾扮演了能源部的角色，其下轄煤炭、石油、電力、水電建設四個總局，隨著這些總局職能的擴大，1955年7月，燃料工業部被撤銷。
1982年，能源部再度設立，當時名為國務院能源委員會。當時與能源委員會平級存在的還有石油部、電力部、煤炭部、工業部等，后來由于與國家計委職責不清，能源委員會實際上被架空，在運作兩年之后便被撤銷。
1988年，國家再次成立能源部，但由于石油工業總公司、核工業總公司沒有加入，能源部管轄領域僅限電力和煤炭，此后煤炭退出，能源部名不副實，1993年第八屆人大一次會議通過了撤銷能源部、設立電力部的方案。
2005年國務院成立國家能源領導小組，作為高級議事機構，由國務院總理溫家寶擔任主任，涵蓋13個部委，負責擬訂國家能源發展戰略和規劃、研究能源開發與節約、能源安全與應急、能源對外合作等重大政策等。
2008年大部制改革，能源部并未成立，出爐的僅是國家能源局，設在國家發改委門下，為副部級單位。這被認為是機構改革的折中產物。
國家能源局設立后，不再保留國家能源領導小組及其辦事機構。該局涵蓋了此前發改委下屬的司局級能源局有關職責，并且整合了國家能源領導小組辦公室的職責以及國防科學技術工業委員會的核電管理職責。
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